Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC129Q6ZRS4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC129Q6ZRS4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms