Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN03

LINC00322, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00322, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00322Q6ZN03 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00322Q6ZN03 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms