Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINGO4Q6UY18 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms