Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREML4Q6UXN2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREML4Q6UXN2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms