Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms