Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCBE1Q6UXH8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms