Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCL17Q6UXB2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCL17Q6UXB2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms