Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF7Q6Q0C0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF7Q6Q0C0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms