Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM4Q6P4Q7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNNM4Q6P4Q7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms