Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC42EP5Q6NZY7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC42EP5Q6NZY7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms