Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H3F3CQ6NXT2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms