Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRRC8EQ6NSJ5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRRC8EQ6NSJ5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms