Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF6Q6KF10 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms