Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNS3Q68CZ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms