Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USPL1Q5W0Q7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USPL1Q5W0Q7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms