Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf57Q5W0N0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms