Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF20Q5VTR2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF20Q5VTR2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms