Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HES3Q5TGS1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms