Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF3Q5SZQ8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CELF3Q5SZQ8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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