Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC93Q567U6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC93Q567U6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms