Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL12Q53G59 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL12Q53G59 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms