Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP29Q52LW3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms