Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms