Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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