Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS9Q3SYG4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms