Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TWISTNBQ3B726 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TWISTNBQ3B726 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms