Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSPP1Q1MSJ5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSPP1Q1MSJ5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms