Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPRNQ16849 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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