Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA3Q16787 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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