Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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