Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F4Q16254 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms