Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIK4Q16099 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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