Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALX1Q15699 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALX1Q15699 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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