Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRRQ15256 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms