Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HNF4GQ14541 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms