Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNC3Q14003 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNC3Q14003 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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