Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PDE6HQ13956 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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