Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP1Q13835 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP1Q13835 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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