Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOFQ13790 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms