Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALCAMQ13740 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms