Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEUROD1Q13562 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEUROD1Q13562 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms