Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B2Q13367 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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