Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD2Q13200 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms