Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1IP1Q13113 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1IP1Q13113 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms