Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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FOXC1Q12948 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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FOXC1Q12948 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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FOXC1Q12948 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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FOXC1Q12948 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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FOXC1Q12948 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXC1Q12948 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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