Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPN13Q12923 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN13Q12923 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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