Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRJQ12913 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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