Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMAN2Q12907 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms