Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN2AQ12879 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
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