Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREBF2Q12772 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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